Les paramètres physiques et chimiques de l'environnement, tels que l'intensité de la lumière, la durée du jour, la température et les nutriments (par exemple le  nitrates, le phosphate, les vitamines, le fer) ont un impact majeur sur la physiologie des communautés microbiennes, y compris le phytoplancton eucaryotes, les cyanobactéries et les bactéries hétérotrophes. 

Les principales questions abordées sont :

• Comment les bactéries hétérotrophes et le phytoplancton s'acclimatent et s'adaptent-ils aux concentrations de fer comme celles rencontrées dans de grandes régions de l'océan mondial?
• Comment la longueur et la température du jour affectent-elles la croissance, la prolifération et la saisonnalité du phytoplancton et des bactéries ?
• Comment les rayons UV et PAR influencent-ils la survie du bactérioplancton et les cycles du carbone et de l'azote ?
• Comment les facteurs environnementaux régulent l'excrétion de matière organique dissoute par les bactéries et le phytoplancton ?

Nous utilisons des approches du gène à l'écosystème, tels que des transformations génétiques sur des modèles d'organismes du phytoplancton et des bactéries, des expériences en microcosmes dans des conditions de laboratoire bien définies, des études sur le terrain sur des communautés microbiennes et des campagnes océanographiques à grande échelle.